我国两株登革2型病毒基因组的全序列分析

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1军事医学科学院微生物流行病研究所,北京,100071


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本研究对我国两株登革2型病毒D2-43株、D2-04株的基因组进行了全序列测定,在此基础上对这两株引起不同临床症状及鼠神经毒力的登革病毒的基因组序列进行了比较分析,结果表明D2 43株与D2-04株基因组全长约为10 723nt,核苷酸序列的同源性为95.1%,氨基酸序列的同源性为97 6%,不存在特别的高变区.这两株序列中共有83个核苷酸的变化导致了氨基酸的变化,其中21个差异氨基酸可引起所在位点电荷或极性的变化,位于登革病毒粒子表面的E糖蛋白第126位氨基酸由Glu(D2-04株)→Lys(D2-43株)的变化对其抗原性有影响,可能引起了病毒对鼠神经毒力的改变.对结构糖蛋白E基因的聚类分析表明D2-43株与新几内亚株、台湾87株及菲律宾83株亲缘关系较近,D2-04株与牙买加株及巴西90年分离株的亲缘关系较近,表明我国存在不同起源的登革2型病毒感染.

[1] Kautner I;Robinson M J;Kubnle U .Dengue virus infection:epidemiology pathogenesis clinical presentation diagnosis and prevention[J].Journal of Pediatrics,1997,131:516-524.

[2] Irie K;Mohan P M;Sasaguri Y et al.Sequence analysis of cloned dengue virus type 2 genome( New guinea C strain)[J].Gene,1998(75):197-211.

[3] Li H;Clum S;You S;Ebner KE;Padmanabhan R .The serine protease and RNA-stimulated nucleoside triphosphatase and RNA helicase functional domains of dengue virus type 2 NS3 converge within a region of 20 amino acids.[J].Journal of Virology,1999(4):3108-3116.

[4] O' Reilly EK;Kao CC .Analysis of RNA-dependent RNA polymerase structure and function as guided by known polymerase structures and computer predictions of secondary structure[J].Virology,1998(2):287-303.

[5] Lewis J A;Chang G J;Lanciotti R S et al.Phylogenetic relationships of dengue-2 viruses[J].Virology,1993,197:216-224.

[6] Rey F A;Heinz F X;Mandl C et al.The envelope glycoprotein from tick-brone encephalitis virus at 2A° resolution[J].Nature,1995,375:291-298.

[7] GualanoRC;PryrMJ;CauchiMR et al.The identification of a maor determinant of mouse neurovirulence of dengue virus type 2 using stably cloned genomic length cDNA[J].Journal of General Virology,1998,79:437-446.

[8] Ko Y C;Chen M J;Yeh S M .The predisposing and protective factors against dengue virus transmission by mosquito vector[J].American Journal of Epidemiology,1992,136:214-220.

[9] Rico Hesse R;Harrison LM;Salas RA;Tov .Origins of dengue type 2 viruses associated with increased pathogenicity in the Americas.[J].Virology,1997(2):244-251.


语种: 英文   

基金国家自然科学基金(30000144)

关键词登革病毒 基因组 序列分析


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